Skip to content
Documentacion Uso

Documentacion Uso

logoHPCblanco_0

Producción científica

Manual de uso

Uso básico
Acceso remoto
¿Cómo acceder al cluster?
Linea de comando y otros comandos
Algunos comandos básicos para el uso de la terminal de Linux.
QoS (Quality of Service)
Límite de recursos disponibles para cada user.
Quota
Límite de almacenamiento disponible por user.
SLURM básico
Uso de básico de SLURM
¿Cómo enviar trabajos al Cluster por medio del manejador de colas
SLURM?
Scripts de cola
Algunos ejemplos de scripts de cola
Monitoreo de cálculos
¿Cómo verificar que un cálculos está corriendo en paralelo?
Ejecución de trabajos en interactivo
¿Cómo hacer pruebas de trabajo de manera interactiva?
SLURM avanzado
Job Arrays
Paralelización de software secuencial (en serie) independientes
entre sí por medio de arrays.
GNU Parallel
Paralelización de software secuencial (en serie) independientes
entre sí.
GPU para HPC
Ejecución en paralelo en los nodos GPU.
Cálculos que dependen de otros cálculos
Automatización de la cola para cuanto tenemos cálculos que dependen
de cálculos anteriores.

Software

Cómo instalar software en el cluster?
Instalación de software
Diferentes maneras de instalar software en el cluster.
Algunos scripts de instalación
Scripts personalizados para la instalación software en el cluster.
Contenedores Singularity para Bioinformática
Listado de contenedores Singularity de bioinformática instalados.
Bases de datos de bioinformática
Algunas bases de datos disponibles públicamente.
LHCb/ALLEN
https://allen-doc.docs.cern.ch/index.html.
Machine Learning
Ollama
Ejecución e instalación de Ollama
TensorFlow
Instalación de TensorFlow
PyTorch
Instalación de PyTorch

Contacto

📧 servicio.hpc@ucr.ac.cr

🖥️ https://hpc.ucr.ac.cr

puntosHPC_0.svg